Historia tytułu słynnej płyty nie jest jasna. Jedni twierdzą, że ta początkowo miała zostać nazwana "Our Freaky Friends", jeszcze inni, że termin Pet Sounds wybrano jeszcze przed rozpoczęciem sesji nagraniowych. On sam z jednej strony miał się odnosić do slangowego słowa, oznaczającego potajemne spotkania zakochanych, z drugiej - nawiązywać do zdjęć zoo, które wisiały w studiu i do dźwięków, wydawanych przez zwierzęta, które pojawiają się na albumie. Sam Brian Wilson również przedstawiał kilka wersji wspominając o nazwaniu płyty na cześć swoich psów, czy jako hołd dla Phila Spectora.