Okładkę albumu Rust in Peace stworzył Ed Repka, który już wcześniej współpracował z Megadeth (to on odpowiada również za oprawę graficzną Peace Sells... but Who's Buying? z 1986). Przedstawia ona maskotkę zespołu Vica Rattleheada oraz światowych przywódców tamtej epoki, którzy oglądają obce ciało. Widzimy m.in. Michaiła Gorbaczowa czy George'a H.W. Busha. 

Album Rust in Peace był nominowany do nagrody Grammy w kategorii "Best Metal Performance". Dave Mustaine i spółka przegrali jednak z... Metalliką. Była grupa lidera Megadeth zgarnęła statuetkę za cover Stone Cold Crazy Queen. 

Jeśli chodzi o tytuł albumu, to wpadł na niego Mustaine. A to wszystko za sprawą... naklejki na zderzak, którą zobaczył na jednym z samochodów, kiedy wracał do domu z Lake Elsinore w Kalifornii. Widniał na niej napis: "Oby cała twoja broń jądrowa zardzewiała w pokoju". Liderowi Megadeth tak bardzo się to zdanie spodobało, że postanowił użyć fragment tego stwierdzenia. 

Marty Friedman zmagał się z pewnymi kłopotami w trakcie nagrywania utworu Five Magics. – Pod koniec miałem problem z dopracowaniem szybkiego, thrashowego rytmu, więc Mike Clink dał mi jedną z leżących pod ręką kostek gitarowych Slasha i od razu udało mi się dopracować tę partię. To była magia – powiedział gitarzysta (cytat za portalem Ultimate Guitar). 

Tytuł utworu Lucretia został zainspirowany postacią Lukrecji z rodu Borgiów, która była córką papieża Aleksandra VI. Nie miała ona jednak dobrej reputacji. Przypisywano jej chociażby kazirodcze stosunki z ojcem i bratem Cezarem.